Článek v odborném periodiku
HAVRDOVÁ, A. – DOUDA, J. Local topography affects seed bank successional patterns in alluvial meadows. Flora, 2015, roč. 2015, č. 217, s. 155-163. ISSN: 0367-2530.
KRAK, K. – VÍT, P. – BELYAYEV, DR., A. – DOUDA, J. – MARKOVÁ, L. – MANDÁK, B. Allopolyploid origin of Chenopodium album s. str. (Chenopodiaceae): A molecular and cytogenetic insight. PLoS One, 2016, roč. 11(8): e0161063, č. , s. 1-22. ISSN: 1932-6203.
DOUDOVÁ, J. – DOUDA, J. Along with intraspecific functional trait variation, individual performance is key to resolving community assembly processes. FUNCTIONAL ECOLOGY, 2020, roč. 34, č. 11, s. 2362-2374. ISSN: 0269-8463.
ŠMÍD, J. – DOUDA, J. – KRAK, K. – MANDÁK, B. Analyses of Hybrid Viability across a Hybrid Zone between Two Alnus Species Using Microsatellites and cpDNA Markers. Genes, 2020, roč. 11, č. 7, s. 1-18. ISSN: 2073-4425.
**CHYTRÝ, M. – **HÁJEK, M. – **KOČÍ, M. – **PEŠOUT, P. – **ROLEČEK, J. – **SÁDLO, J. – **ŠUMBEROVÁ, K. – **SYCHRA, J. – BOUBLÍK, K. – DOUDA, J. – **GRULICH, V. – **HÄRTEL, H. – **HÉDL, R. – **LUSTYK, P. – **NAVRÁTILOVÁ, J. – **NOVÁK, P. – **PETERKA, T. – **VYDROVÁ, A. – **CHOBOT, K. Červený seznam biotopů České republiky. Příroda, 2020, roč. 41, č. , s. 1-172. ISSN: 1211-3603.
DRAŠNAROVÁ, A. – KRAK, K. – VÍT, P. – DOUDOVÁ, J. – DOUDA, J. – HADINCOVÁ, V. – ZÁKRAVSKÝ, P. – MANDÁK, B. Cross-amplification and multiplexing of SSR markers for Alnus glutinosa and A. incana. Tree Genetics & Genomes, 2014, roč. 10, č. 4, s. 865-873. ISSN: 1614-2942.
KRAK, K. – **VÍT, P. – DOUDA, J. – MANDÁK, B. Development of 18 microsatellite markers for Salvia pratensis (Lamiaceae).. Applications in Plant Sciences , 2020, roč. 8, č. 1, s. 1-4. ISSN: 2168-0450.
DOUDA, J. – ČEJKOVÁ, A. – DOUDA, K. Development of alder carr after the abandonment of wet grasslands during the last 70 years. Annals of Forest Science, 2009, roč. 66, č. 7, s. 712 - 725. ISSN: 1286-4560.
ŠMÍD, J. – **VÍT, P. – DOUDA, J. – KRAK, K. – MANDÁK, B. Distribution, hybridisation and morphological variation in Alnus rohlenae (Betulaceae) an endemic species of the Balkan Peninsula. European Journal of Forest Research, 2022, roč. 141, č. 4, s. 641-648. ISSN: 1612-4669.
MANDÁK, B. – VÍT, P. – KRAK, K. – HAVRDOVÁ, A. – TRÁVNÍČEK, P. – HADINCOVÁ, V. – JAROLÍMOVÁ, V. – BACLES, C. – DOUDA, J. Flow cytometry, microsatellites and niche models reveal the origins and geographical structure of Alnus glutinosa populations in Europe. Annals of Botany, 2016, roč. 117, č. 1, s. 107-120. ISSN: 0305-7364.
DOUDA, J. Formalized classification of the vegetation of alder carr and floodplain. Preslia, 2008, roč. 80, č. 2, s. 199 - 224. ISSN: 0032-7786.
DOUDA, J. – ŽÁRNÍK, M. Fytocenologická a geobiocenologická studie bučin Třeboňska. Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích, 2007, roč. 47, č. 1, s. 71 - 89. ISSN: 0139-8172.
VÍT, P. – KRAK, K. – TRÁVNÍČEK, P. – DOUDA, J. – LOMONOSOVA, M. – MANDÁK, B. Genome size stability across Eurasian Chenopodium species (Amaranthaceae). BOTANICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 2016, roč. 182, č. 3, s. 637-649. ISSN: 0024-4074.
DOUDA, J. Geranium sibiricum L.. Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích, 2007, roč. 46, č. 1, s. 1 - 0. ISSN: 0139-8172.
HULÍK, J. – DOUDA, J. Germination strategies of two dominant Carex species in a swamp alder forest: implications for restoration. Biologia, 2017, roč. 72, č. 4, s. 370-377. ISSN: 0006-3088.
HAVRDOVÁ, A. – DOUDA, J. – KRAK, K. – VÍT, P. – HADINCOVÁ, V. – ZÁKRAVSKÝ, P. – MANDÁK, B. Higher genetic diversity in recolonized areas than in refugia of Alnus glutinosa triggered by continent-wide lineage admixture. Molecular Ecology, 2015, roč. 24, č. 18, s. 4759-4777. ISSN: 0962-1083.
MANDÁK, B. – KRAK, K. – VÍT, P. – PAVLÍKOVÁ, Z. – LOMONOSOVA, M. – LOMONOSOVA, M. – HABIBI, F. – WANG, L. – JELLEN, E. – DOUDA, J. How genome size variation is linked with evolution within Chenopodium sensu lato. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2016, roč. 2016, č. 23, s. 18-32. ISSN: 1433-8319.
KRAK, K. – **HABIBI, F. – DOUDA, J. – VÍT, P. – **LOMONOSOVA, M. – **WANG, L. – MANDÁK, B. Human-mediated dispersal of weed species during the Holocene: A case study of Chenopodium album agg. . Journal of Biogeography, 2019, roč. 46, č. 5, s. 1007-1019. ISSN: 0305-0270.
MANDÁK, B. – KRAK, K. – VÍT, P. – **LOMONOSOVA, M. – **BELYAYEV, DR., A. – **HABIBI, F. – **WANG, L. – DOUDA, J. – **ŠTORCHOVÁ, H. Hybridization and polyploidization within the Chenopodium album aggregate analysed by means of cytological and molecular markers.. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2018, roč. 2018, č. 129, s. 189-201. ISSN: 1055-7903.
DOUDA, J. – DOUDOVÁ, J. – HOLEŠTOVÁ, A. – BOUBLÍK, K. – HAVRDOVÁ, A. – **SLEZÁK, M. Interplay of above- and belowground resource limitations: a competition-facilitation shift maintains species coexistence. Oikos, 2021, roč. 130, č. 12, s. 1-14. ISSN: 0030-1299.
SVOBODA, M. – JANDA, P. – BAČE, R. – FRAVER, S. – NAGEL, T. – REJZEK, J. – MIKOLÁŠ, M. – DOUDA, J. – BOUBLÍK, K. – ŠAMONIL, P. – ČADA, V. – TROTSIUK, V. – TEODOSIU, M. – BOURIAUD, O. – BIRIS, A. – SÝKORA, O. – UZEL, P. – ZELENKA, P. – SEDLÁK, V. – LEHEJČEK, J. Landscape-level variability in historical disturbance in primary Picea abies mountain forests of the Eastern Carpathians, Romania. Journal of Vegetation Science, 2014, roč. 25, č. 2, s. 386-401. ISSN: 1100-9233.
DOUDA, J. – HAVRDOVÁ, A. – DOUDOVÁ, J. – MANDÁK, B. Legacy of post-glacial colonization affects ß-diversity: Insights into local community assembly processes. Journal of Biogeography, 2018, roč. 45, č. 7, s. 1604-1615. ISSN: 0305-0270.
**VÍT, P. – KRAK, K. – DOUDA, J. – MANDÁK, B. Microsatellite markers for Anthericum ramosum (Agavaceae): Development, characterisation and cross-species amplification. . Applications in Plant Sciences , 2020, roč. 8, č. 5, s. 1-5. ISSN: 2168-0450.
DOUDA, J. – DOUDOVÁ, J. – DRAŠNAROVÁ, A. – KUNEŠ, P. – HADINCOVÁ, V. – KRAK, K. – ZÁKRAVSKÝ, P. – MANDÁK, B. Migration Patterns of Subgenus Alnus in Europe since the Last Glacial Maximum: A Systematic Review. PLoS One, 2014, roč. 9, č. 2, s. 1-14. ISSN: 1932-6203.
DOUDA, J. – HAVRDOVÁ, A. – JANDA, P. – MANDÁK, B. Molecular assessment of natural disturbance regime in a temperate swamp forest. Forest Ecology and Management, 2020, roč. 460, č. 117821, s. 1-11. ISSN: 0378-1127.
HODKOVÁ, E. – DOUDOVÁ, J. – DOUDA, J. – KRAK, K. – MANDÁK, B. On the road: Postglacial history and recent expansion of the annual Atriplex tatarica in Europe. Journal of Biogeography, 2019, roč. 2019, č. 8, s. 0-13. ISSN: 0305-0270.
**DIVÍŠEK, J. – **VEČEŘA, M. – **WELK, E. – **DANIHELKA, J. – **CHYTRÝ, K. – DOUDA, J. – **CHYTRÝ, M. Origin of the central European steppe flora: insights from palaeodistribution modelling and migration simulations. Ecography, 2022, roč. 2022, č. 12, s. 1-17. ISSN: 0906-7590.
DOUDA, J. – DOUDOVÁ-KOCHÁNKOVÁ, J. – BOUBLÍK, K. – DRAŠNAROVÁ, A. Plant species coexistence at local scale in temperate swamp forest: test of habitat heterogeneity hypothesis. Oecologia, 2012, roč. 169, č. 2, s. 523-534. ISSN: 0029-8549.
HOLEŠTOVÁ, A. – DOUDA, J. Plant species over-occupancy indicates river valleys are natural corridors for migration. Plant Ecology, 2021, roč. neuvedeno, č. October, s. 0-0. ISSN: 1385-0237.
DOUDA, J. – DOUDOVÁ, J. – HODKOVÁ, E. – **VÍT, P. – KRAK, K. – MANDÁK, B. Population history explains the performance of an annual herb - Within and beyond its European species range. Journal of Ecology, 2020, roč. 108, č. 3, s. 958-968. ISSN: 0022-0477.
DOUDA, J. – LEPŠÍ, M. – LEPŠÍ, P. – ŠTECH, M. Příspěvek k poznání květeny a vegetace Staré obory u Hluboké nad Vltavou . Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích, 2007, roč. 47, č. 1, s. 127 - 135. ISSN: 0139-8172.
HÉDL, R. – ROLEČEK, J. – BOUBLÍK, K. – DOUDA, J. – SVOBODA, M. Prohlášení České botanické společnosti aneb deset témat pro českou lesnickou politiku. Zprávy České botanické společnosti - , 2009, roč. 44, č. 24, s. 3 - 7. ISSN: 1211-5258.
MANDÁK, B. – HAVRDOVÁ, A. – KRAK, K. – HADINCOVÁ, V. – VÍT, P. – ZÁKRAVSKÝ, P. – DOUDA, J. Recent similarity in distribution ranges does not mean a similar postglacial history: a phylogeographical study of the boreal tree species Alnus incana based on microsatellite and chloroplast DNA variation.. New Phytologist, 2016, roč. 210, č. 4, s. 1395-1407. ISSN: 0028-646X.
**CHYTRÝ, M. – **HÁJEK, M. – **KOČÍ, M. – **PEŠOUT, P. – **ROLEČEK, J. – **SÁDLO, J. – **ŠUMBEROVÁ, K. – **SYCHRA, J. – BOUBLÍK, K. – DOUDA, J. – **GRULICH, V. – **HÄRTEL, H. – **HÉDL, R. – **LUSTYK, P. – **NAVRÁTILOVÁ, J. – **NOVÁK, P. – **PETERKA, T. – **VYDROVÁ, A. – **CHOBOT, K. Red List of Habitats of the Czech Republic. ECOLOGICAL INDICATORS, 2019, roč. 106, č. , s. 1-12. ISSN: 1470-160X.
DOUDA, J. – DOUDOVÁ, J. – HULÍK, J. – HAVRDOVÁ, A. – BOUBLÍK, K. Reduced competition enhances community temporal stability under conditions of increasing environmental stress. Ecology, 2018, roč. 99, č. 10, s. 2207-2216. ISSN: 0012-9658.
ŠAMONIL, P. – ŠEBKOVÁ, B. – DOUDA, J. – VRŠKA, T. Role of position within the windthrow in forest floor chemistry in the flysch zone of the Carpathians . Canadian Journal of Forest Research-Revue Canadienne de Recherche Forestiere, 2008, roč. 38, č. 6, s. 1646 - 1660. ISSN: 0045-5067.
DOUDOVÁ, J. – DOUDA, J. – MANDÁK, B. The complexity underlying invasiveness precludes the identification of invasive traits: A comparative study of invasive and noninvasive heterocarpic Atriplex congeners. PLoS One, 2017, roč. 12, č. 4, s. 1-16. ISSN: 1932-6203.
DOUDA, J. The role of landscape configuration in plant composition of floodplain forests across different physiographic areas. Journal of Vegetation Science, 2010, roč. 21, č. 6, s. 1110 - 1124. ISSN: 1100-9233.
**SLEZÁK, M. – DOUDA, J. – **SIBIKOVA, M. – **JAROLIMEK, I. – **SENKO, D. – **HRIVNAK, R. Topographic indices predict the diversity of Red List and non-native plant species in human-altered riparian ecosystems. ECOLOGICAL INDICATORS, 2022, roč. 2022, č. 139, s. 1-10. ISSN: 1470-160X.
DOUDA, J. – BOUBLÍK, K. – DOUDOVÁ, J. Traditional forest management practices stop forest succession and bring back rare plant species. Journal of Applied Ecology, 2017, roč. 54, č. 3, s. 761-771. ISSN: 0021-8901.
DOUDOVÁ, J. – DOUDA, J. – BOUBLÍK, K. Traditional human practices protect diversity of open forests threatened by ticking nutrient time bomb. Biological Conservation, 2022, roč. 275, č. November, s. 1-11. ISSN: 0006-3207.
VÍT, P. – DOUDA, J. – KRAK, K. – HAVRDOVÁ, A. – MANDÁK, B. Two new polyploid species closely related to Alnus glutinosa in Europe and North Africa – An analysis based on morphometry, karyology, flow cytometry and microsatellites. TAXON, 2017, roč. 66, č. 3, s. 567-583. ISSN: 0040-0262.
ŠAMONIL, P. – KRÁL, K. – DOUDA, J. – ŠEBKOVÁ, B. Variability in forest floor at different spatial scales in a natural forest in the Carpathians: effect of windthrows and mesorelief. Canadian Journal of Forest Research-Revue Canadienne de Recherche Forestiere, 2008, roč. 38, č. 10, s. 2596 - 2606. ISSN: 0045-5067.
DOUDA, J. – BOUBLÍK, K. – SLEZÁK, M. – BIURRUN, I. – NOCIAR, J. – HAVRDOVÁ, A. – AĆIĆ, S. – BRISSE, H. – BRUNET, J. – CHYTRÝ, M. – CLAESSENS, H. – CSIKY, J. – DIDUKH, Y. – DIMOPOULOS, P. – DULLINGER, S. – FITZPATRICK, Ú. – GUISAN, A. – HORCHLER, P. – HRIVNÁK, R. – JANDT, U. – KĄCKI, Z. – KEVEY, B. – LANDUCCI, F. – LECOMTE, H. – LENOIR, J. – PAAL, J. – PATERNOSTER, D. – PAULI, H. – PIELECH, R. – RODWELL, J. – ROELANDT, B. – SVENNING, J. – ŠIBÍK, J. – ŠILC, U. – ŠKVORC, Ž. – TSIRIPIDIS, I. – TZONEV, R. – WOHLGEMUTH, T. – ZIMMERMANN, N. Vegetation classification and biogeography of European floodplain forests and alder carrs. Applied Vegetation Science, 2016, roč. 19, č. 1, s. 147-163. ISSN: 1402-2001.
DOUDA, J. – HULÍK, J. – DOUDOVÁ, J. Vegetative sprouting as an additional pathway for a seed size-number trade-off: a field-parameterised simulation approach. COMMUNITY ECOLOGY, 2017, roč. 17, č. 2, s. 205-215. ISSN: 1585-8553.
BOUBLÍK, K. – **LEPŠÍ, P. – **ŠTECH, M. – **PRANČL, J. – **KOUTECKÝ, P. – **ŠTĚPÁNEK, J. – **VYMYSLICKÝ, T. – **GRULICH, V. – **ŠTEFÁNEK, M. – **LEPŠÍ, M. – **LIPPL, L. – **KOTILÍNEK, M. – **PRACH, K. – **LUSTYK, P. – **CHRTEK, J. – **HROUDA, L. – **URFUS, T. – **PAULIČ, R. – DOUDA, J. – **VELEBIL, J. – **HLISNIKOVSKÝ, D. Výsledky floristického kurzu České botanické společnosti v Jindřichově Hradci (2–7. července 2017). Zprávy České botanické společnosti, 2019, roč. 54, č. 2, s. 243-345. ISSN: 1211-5258.
Kapitoly v odborné knize
BOUBLÍK, K. – DOUDA, J. – HÉDL, R. – CHYTRÝ, M. Vegetace České republiky 4. Lesní a křovinná vegetace. Praha: Academia, 2013, 551s. ISBN 978-80-200-2299-8. Mezofilní a vlhké opadavé listnaté lesy, s. 198-216.
DOUDA, J. Vegetace České republiky 4. Lesní a křovinná vegetace. Praha: Academia, 2013, 550s. ISBN 978-80-200-2299-8. Mokřadní olšiny a vrbiny, s. 166-180.
NEUÄUSLOVÁ, Z. – DOUDA, J. – CHYTRÝ, M. Vegetace České republiky 4. Lesní a křovinná vegetace. Praha: Academia, 2013, 551s. ISBN 978-80-200-2299-8. Poříční vrbové křoviny a vrbotopolové luhy, s. 45-66.
DOUDA, J. Biota Novohradských hor: modelové taxony společenstva a biotopy. České Budějovice: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2004. 1s. ISBN 80-7040-756-5. s. Vegetace lesů, s. 41 - 48.
Ostatní výsledky
Assemblages of invertebrate detritivores in relation to organic matter processes in the springs of the Blanice river basin (Bohemian Forest, Czech Republic) Mgr. Bílý Michal, Ph.D.; Ing. Kubíková Lucie; Simon Ondřej; Ing. Douda Jan, Ph.D.; Dort Bohumil, 2008
Bezkontaktní výuka v biologických předmětech Ing. Douda Jan, Ph.D., 2004
Diverzita humusových forem na vývratech v jedlobučinách flyšového pásma Karpat Ing. Douda Jan, Ph.D.; Šebková Barbora; Ing. Šamonil Pavel, Ph.D., 2007
Diverzita, dynamika a management lesní vegetace Ing. Douda Jan, Ph.D.; Hédl Radim; doc. Ing. Svoboda Miroslav, Ph.D., 2008
Dynamika a geobiocenologická typizace mokřadních olšin Ing. Douda Jan, Ph.D., 2004
Flóra a vegetace PR Milá (České středohoří) - současný stav a trendy dalšího vývoje Ing. Joza Vít; Ing. Douda Jan, Ph.D., 2005
Formalized vegetation classification of alder carrs and floodplain forests in the Czech Republic – an ecological interpretation Ing. Douda Jan, Ph.D., 2008
SVOBODA, M. – JANDA, P. – BAČE, R. – NAGEL, T. – FRAVER, S. – REJZEK, J. – DOUDA, J. – BOUBLÍK, K. Podtyp: Příspěvek ve sborníku (mimo kategorie RIV); Historical range of variability in temperate mountain spruce forests of Central Europe. 2011. Konference, Eurodendro 2011, Engelberg, Švýcarsko, 19-23.9. 2011, .
Lindernia dubia (L.) Pennel Ing. Douda Jan, Ph.D.; Lepší Martin, 2005
Mokřadní a lužní lesy a křoviny okolí Bechyně Ing. Douda Jan, Ph.D., 2004
O vegetační proměnlivosti a původu současných lužních lesů Ing. Douda Jan, Ph.D., 2009
Otázky a odpovědi, které přináší studium mokřadních olšin ČR Ing. Douda Jan, Ph.D., 2005
Příčiny variablility mokřadních olšin a lužních lesů Jihočeského kraje a porovnání tří způsobů jejich klasifikace Ing. Douda Jan, Ph.D., 2004
Problematika lesnické typologie VI Ing. Douda Jan, Ph.D.; Ing. Joza Vít, 2004
Proč studovat potenciální přirozenou vegetaci, když se všechno mění a nic není takové, jak se zdá? Ing. Douda Jan, Ph.D.; Ing. Šamonil Pavel, Ph.D., 2007
Rubus josholubii H.E. Weber Ing. Douda Jan, Ph.D., 2004
Spring areas in the Bohemian Forest, Czech Republic - heterogeneous detrital reactors Mgr. Fricová Kamila; Simon Ondřej; Ing. Douda Jan, Ph.D.; Kladivová Věra, 2008
Vegetační stupňovitost Blanského lesa Ing. Douda Jan, Ph.D.; Ing. Žárník Milan, 2004
Veronica peregrina L. Ing. Douda Jan, Ph.D.; Lepší Petr, 2005
